การบุกรุกเข้าครอบครองพื้นที่เขากระโดงเกือบห้าพันไร่มาอย่างยาวนาน และมีข้อสงสัยว่าอาจมีการใช้อำนาจมิชอบ หรือมีขบวนการสมยอมภายในราชการ ทำให้ที่ดินเขากระโดงสามารถออกโฉนดที่ดินได้ กรมที่ดินถูกวิจารณ์ว่าอาจอุ้มคนที่บุกรุกที่ดินสาธารณะเขากระโดง โดยขัดขืนไม่ยอมเพิกถอนโฉนด โดยอ้างเหตุผล ดังนี้
1.ถึงแม้ศาลฎีกา จะพิพากาตัดสินว่าพื้นที่เขากระโดงเป็นที่ดินของการรถไฟแห่งประเทศไทย แต่กรมที่ดินอ้างว่าไม่ได้เป็นคู่ความโดยตรง จึงไม่ผูกพันตนตามกฎหมายปกครอง กรมที่ดินก็จึงสงวนสิทธิ์ไม่ดำเนินการเพิกถอนโฉนดที่ดินเขากระโดงห้าพันไร่เด็ดขาด
2. อีกทั้งคณะกรรมการสอบสวนของกรมที่ดินที่ตั้งขึ้นมาพิจารณาการดำเนินการตามคำพิพากษา มีความเห็นว่า ไม่ควรเพิกถอนโฉนดที่ดินห้าพันไร่เขากระโดงเด็ดขาด เพราะเห็นว่า รฟท. ไม่มีเอกสารสิทธิ์เด็ดขาดในพื้นที่เขากระโดงแต่อย่างใดเลย จะให้กรมที่ดินเอาหลักฐานอะไรมาเป็นเหตุให้เพิกถอนโฉนดที่ดินของเขา กรมที่ดินมีความสงสัยว่าศาลตัดสินอะไรมามั่วๆ หรือเปล่า

3. อธิบดีกรมที่ดินก็อ้างมติคณะกรรมการนี้ เพื่อออกคำสั่ง “ไม่เพิกถอน” โฉนด แปลว่าคนครอบครองยังอยู่ได้ต่อไปชั่วลูกชั่วหลาน